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[1]李華水,謝文焌,林強,等.橋本氏甲狀腺炎差異基因篩選、分析及潛在治療藥物預(yù)測[J].福建醫(yī)藥雜志,2021,43(04):18-22.
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橋本氏甲狀腺炎差異基因篩選、分析及潛在治療藥物預(yù)測()
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《福建醫(yī)藥雜志》[ISSN:1002-2600/CN:35-1071/R]

卷:
43
期數(shù):
2021年04期
頁碼:
18-22
欄目:
臨床研究
出版日期:
2021-08-15

文章信息/Info

文章編號:
1002-2600(2021)04-0018-05
作者:
李華水; 謝文焌; 林強; 陳雨征1; 程雪飛; 陳梅琴
福建省立醫(yī)院基本外科（福州 350001）
關(guān)鍵詞:
橋本氏甲狀腺炎; 生物信息學分析; 差異表達基因; 免疫反應(yīng); 潛在治療藥物
分類號:
R581.4
文獻標志碼:
A
摘要:
目的 通過生物信息學技術(shù)篩選出橋本氏甲狀腺炎（HT）差異表達基因，對差異基因進行分析得出與HT發(fā)生及發(fā)展密切相關(guān)的基因，并通過核心基因預(yù)測潛在的HT治療藥物。 方法 采用GEO2R在線工具分析HT數(shù)據(jù)集GSE6339和 GSE138198，獲取HT差異表達基因。通過Webgestalt數(shù)據(jù)庫分析差異表達基因的生物學過程、細胞成分、分子功能及富集的信號通路，通過String數(shù)據(jù)庫構(gòu)建HT差異表達基因蛋白互作相關(guān)作用（PPI）網(wǎng)絡(luò)，通過Cytosccape軟件MCC算法計算出差異基因中的10個核心基因，通過Genemania數(shù)據(jù)庫構(gòu)建核心基因分子互作網(wǎng)絡(luò)并通過藥物－基因相互作用數(shù)據(jù)庫(DGIdb）預(yù)測HT潛在治療藥物。 結(jié)果 共篩選出74個HT差異表達基因，其中上調(diào)基因67個，下調(diào)基因7個，生物學功能和信號通路富集分析顯示差異表達基因主要富集于T細胞受體復(fù)合物中參與免疫相關(guān)信號通路。通過String數(shù)據(jù)庫最終得到具58個節(jié)點、342條邊的PPI網(wǎng)絡(luò)，檢測發(fā)現(xiàn)的核心基因間具有共表達、共定位區(qū)域，核心基因主要功能為活化免疫細胞。在藥物-基因相互作用數(shù)據(jù)庫中發(fā)現(xiàn)了3個潛在治療藥物，分別是希普利珠單抗、阿法賽特、依伐利珠單抗。 結(jié)論 HT樣本中共有74個差異表達基因；差異表達基因的功能與機體免疫功能相關(guān)；核心基因主要功能為活化免疫細胞；希普利珠單抗、阿法賽特、依伐利珠單抗是HT潛在的治療藥物。

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備注/Memo

備注/Memo:
1 福建省衛(wèi)生職業(yè)技術(shù)學校
第一作者簡介：李華水(1983-)，男，碩士，副主任醫(yī)師，主要研究方向為甲狀腺相關(guān)疾病診治。Email:[email protected]
通信作者簡介：謝文焌(1989-)，男，碩士，主治醫(yī)師，主要研究方向為甲狀腺相關(guān)疾病診治。Email:[email protected]
更新日期/Last Update: 2021-08-15